Curso de BioEstadística:
Instalando R, rkward y RKTeaching
en minino-picaros (2º parte)
En la primera parte de este post vimos como instalar R y RKward (
1º parte), ahora veremos como instalar RKTeaching.
En este curso se usa un plugings, llamado RKTeaching, que facilita el manejo del programa y la enseñanza. Os digo a continuación los pasos a seguir para su instalación.
Agradecer a José Guerero Alves, Aurora Ledezma, y al blog de Emilio L. Cano, por compartir sus conocimientos y experiencias.
0) Previamente, si no lo teneis instalado en vuestro sistema, hay que instalar en la terminal del sistema varias librerias y compiladores (el g++ y el gfortran):
sudo apt-get install libx11-dev
sudo apt-get install libglu1-mesa-dev
sudo apt-get install libxml2-dev
sudo apt-get install libcurl4-gnutls-dev
sudo apt-get install g++
sudo apt-get install gfortran
sudo apt-get install r-cran-rgl
sudo apt-get build-dep r-cran-rgl
1) Escribir en la consola de R el siguiente comando:
update.packages(checkBuilt = TRUE, ask = FALSE)
Esto sirve para actualizar actualizar también los paquetes a la última versión de R.(Nota: tardará un ratito en hacerlo, pero es muy importante hacerlo para seguir con los siguientes pasos)
2) Escribre en la consola de R, estas lineas, (UNA por UNA):
install.packages("R2HTML",dep=TRUE)
install.packages("car",dep=TRUE)
install.packages("e1071",dep=TRUE)
install.packages("Hmisc",dep=TRUE)
install.packages("ez",dep=TRUE)
install.packages("plyr",dep=TRUE)
install.packages("ggplot2",dep=TRUE)
install.packages("prob",dep=TRUE)
install.packages("devtools",dep=TRUE)
library(devtools)
install_github("asalber/rkTeaching_es")
Nota:
Si tenéis algún mensaje de error, seguramente tendréis que instalar alguna dependencia, alguna librería, o programa. Yo he indicado (en el punto 0) todas las dependencias, librerías y programas que me han sido necesario para instalarlo a mi, pero esto puede depender de vuestra distribución. Echar mano de google si encontrais algún problema ya que yo los he resueltos así (véase Fuentes)
Y reiniciemos el rkward, y se nos muestra información del plugings que acabamos de instalar, le damos a aceptar
Y veremos el pluging ya instalado:
Saludos
Julio
Fuentes:
Foro de www.miriadax.net/web/curso-practico-bioestadistica-r-3edicion (José Guerrero Alves)
http://emilopezcano.blogspot.com/2012/07/librerias-en-r.html (resolver dependencias con la
orden: update.packages(checkBuilt = TRUE, ask = FALSE) )
http://r.789695.n4.nabble.com/problem-with-rgl-package-td887819.html
resolver el error:
checking for X... no
configure: error: X11 not found but required, configure aborted.
Solución: instalar:
sudo apt-get install libx11-dev
sudo apt-get install libglu1-mesa-dev
http://stackoverflow.com/questions/7765429/unable-to-install-r-package-in-ubuntu-11-04
resolver el error:
checking for xml2-config... no
Cannot find xml2-config
ERROR: configuration failed for package ‘XML’
checking for curl-config... no
Cannot find curl-config
ERROR: configuration failed for package ‘RCurl’
